明清时代，在北京的晋商行会，有颜料会馆，由平遥颜料商人行会在明代创建；临襄会馆，由临汾、襄陵油盐粮商人行会在明代创建；临汾东馆，由临汾纸张、干果、烟叶、杂货商行会在明代创建；临汾西馆 ，由临汾商人行会，在明代创建；潞安会馆，由潞安铜、铁、锡、炭、烟商行会，在明代创建；河东会馆,由山西烟商行会在清代创建；太平会馆，由太平县（今属襄汾县）商人行会在清代创建；晋冀会馆，由山西布商行会在清代创建； 通州晋冀会馆，由山西翼城商人行会在清代创建；盂县会馆，由山西孟县氆氇商人行会在清代创建；平定会馆，由山西平定雨衣、钱庄、染坊商人行会在清代创建。“入清以后，晋商设立的会馆有了蓬勃发展，大体上前后在京师设会馆有40处以上”。

“河南赊旗镇地处唐河上游，南流入湖北襄阳（今襄樊）汇入汉水，直通汉口，而北经万城、平顶山，可直达洛阳、开封，是一个“四通八达的水陆要冲，两湖、江西、福建、安徽、河南、河北、山西、陕西九省通衢，也是北京通往云贵驿道的中间站，于是山、陕等省商人纷纷到此建房设店，流寓定居，使赊旗舟楫车马，热闹非凡。……在赊旗店最活跃、最有势力的商人就是山西商人。他们最早来到赊旗店从事茶叶、绸缎、刺绣、木材、食盐、布匹等商品的南北转运，其中茶叶为晋商经营的最大宗商品。……赊旗店正是这条‘茶叶商路’上的一个重要中转站。于是，山西商人为了适应贸易的需要，首先在赊旗店创建了晋商会馆。由上可见，晋商会馆在各城镇商埠的建立，是经商活动的需要。”

在开封，明清两朝山西商人很活跃，他们将西北的皮毛、山货运到开封转发各地，又将南方来的茶叶、绸缎、食糖等运往北方。在河南山西客商云集，遂集资在今老会馆街(龙亭东侧)建了一处山西旅汴商人同乡会馆――山西会馆。后又有陕西、甘肃两地的旅汴商贾加入,山西会馆遂易名为山陕甘会馆。

在山东聊城，明清时期山东运河中段城镇是山西商人分布较为密集的区域,其中,聊城、临清最多,另外茌平、东阿、冠县、南馆陶、高唐、张秋等聊城的县、镇也有不少山西商人。这里水陆交通便利，特别是鲁西地区有来自山西的移民近60万人,其中,东昌府将近占当地总人口的90%,这些迁入移民主要从事农业、手工业和商业活动，与原迁移地保持着密切联系,他们在商贸往来中相互信任，贸易因此频繁。聊城原东关米市街路东的太汾公所(会馆),是康熙年间由山西太原府、汾阳府商人集资兴建的。在东阿县城、冠县南馆陶、阳谷阿城海会寺附近、阳谷张秋等地建有山西会馆。其中,明崇祯年间,西商朱之运、梁儒英等联络众商,捐资修建了“金龙大王庙”(会馆),规模壮观；清代山西商人在张秋傍河建立山西会馆。与此同时,山西商人还联合与自己地缘关系密切的省份商人组成更广泛的地缘商会会馆,如聊城至今保存完好的山陕会馆。